А.П.Левич

ТЕОРЕТИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: ПОИСК

УРАВНЕНИЙ ОБОБЩЕННОГО ДВИЖЕНИЯ.

Резюме

Разработчиками динамических теорий наименее отрефлексирована необходимость конструирования терма времени: унификации и измерения изменений естественных систем. Конструкция метаболических часов позволяет ввести энтропийную параметризацию времени и с ее помощью выводить, а не угадывать уравнения обобщенного движения, в частности, для моделирования экологических сообществ.

Что такое такое теоретическая биология?

С 1974 года группы профессионалов Тартусского, Санкт-Петербургского и Московского университетов проводят региональные и межреспубликанские Школы-семинары по теоретической биологии. Почти на каждой из встреч с успехом проходит дискуссия "Что такое теоретическая биология?" Тема дискуссии не исчерпана по сию пору и простор для размышлений оставлен еще не одному поколению исследователей.

Отбросив многочисленные нюансы, в первом приближении, участников дискуссии можно разделить на сторонников чисто методического статуса теоретической биологии, на приверженцев отождествления теоретической биологии с различными видами знакового, формального моделирования и на апологетов существования у теоретической биологии специфической проблемной области.

"Методисты" понимают под теоретической биологией совокупность способов получения биологических результатов, образно говоря, с помощью карандаша и бумаги. В поле теорбиологической деятельности таким образом попадают все способы обработки анализа, обобщения, предсказания результатов биологических экспериментов и наблюдений. " Модельерский" статус теоретической биологии, по-видимому, оказывается частным случаем ее методического статуса.

Проблемное видение теоретической биологии относит к ее компетенции поиски сущности жизни. Чем живое отличается от неживого? Сводится ли феномен жизни к сложным взаимодействиям сложных молекул? Все ли сущности мира, порождающие феномен жизни, достоверно зарегистрированы и воспроизводимы в научных лабораториях? Естественно, что вопрос о сущности жизни свое полное решение может получить только в экспериментальном исследовании. Но путь к решающим экспериментам лежит через теоретическое осмысление законов природы. Можно выделить два основных взаимодополняющих друг друга типа таких законов - законы формы, ими занимаются научные классификации, и законы изменений - область приложения усилий динамического подхода.

Мне самому вслед за Э.Бауэром (1935) теоретическая биология интересна поиском путей к теории обобщенного движения и поиском источников неравновесности живой материи.

Методология построения динамической теории.

Динамическая теория любого фрагмента реальности обязательно включает ряд компонентов, разработка которых осознанно или неявно выступает этапами создания теории ( Левич,1989):

- Компонент О теории состоит в описании идеализированной структуры элементарного объекта теории.

- Компонент S заключается в перечислении допустимых состояний объектов теории. Другими словами, о компоненте S говорят как о пространстве состояний исследуемой системы.

- Компонент С фиксирует пути изменения объектов, вводя в теорию последовательности допустимых состояний, или процессы.

- Компонент Т есть способ измерения изменений. Способ состоит в выборе естественного объекта, изменения которого принимаются за эталонные, и этот эталон приобретает в теории статус часов. Заметим, что "не существует способа измерения времени, который был бы правильнее, чем другой, тот, который принимается, лишь более удобен" ( Poincare,1898).

- Компонент L теории представляет собой формулировку закона изменений, выделяющего реальное обобщенное движение объектов в пространстве состояний из всех возможных их изменений.

- Компонент I составляет набор интерпретирующих процедур - соглашений о сопоставлении формальным конструктам теории понятий предметной реальности и правил соотнесения этих понятий с экспериментально измеряемыми величинами. Именно интерпретирующие процедуры превращают формальную теоретическую схему в науку о реальности.

Приведу примеры компонентов некоторых динамических теорий:

- В классической механике элементарными объектами являются материальные точки вместе с их положениями и скоростями в физическом пространстве, например, планеты Солнечной системы. Изменения задаются траекториями точек. Пространство состояний есть шестимерное фазовое пространство координат и скоростей. Движения по траекториям параметризуется эталонным движением Земли в поле притяжения Солнца ( или движением маятника в гравитационном поле Земли). Законы изменений для слабых полей и небольших скоростей определяются уравнениями движения Ньютона или в общем случае - Эйнштейна.

- В квантовой механике элементарные объекты - амплитуды вероятностей состояний микрообъектов ( например, энергетических состояний атома). Изменения в пространстве состояний задаются траекториями векторов в бесконечномерном гильбертовом пространстве. Часами обычно служат электромагнитные колебания эталонных атомов. Закон изменений задается уравнениями движения типа Шредингера, Максвелла или Дирака. Аппарат квантовой механики в качестве формального объекта работает с комплекснозначными волновыми функциями и действующими на них операторами. Переход к понятиям макрофизической реальности осуществляется постулируемыми правилами: квадрат волновой функции есть вероятность обнаружить микрочастицы в определенной точке пространства и времени, а собственное значение оператора есть количественное значение соответствующей оператору физической характеристики. Для наблюдения вероятностных распределений требуются, например, интерференционные эксперименты с прохождением частиц через препятствия, а, скажем, энергетические характеристики атома определяются через расстояния между линиями экспериментальных атомных спектров.

- В эмбриологии роль элементарного объекта играет живая клетка, а роль канонических изменений - процесс деления клеток. Пространство состояний описывается морфологическими признаками архетипов зоологических систематик. За видоспецифическую и зависимую от внешних условий единицу "эмбриологического времени" удобно принять интервал между одноименными фазами деления дробления (Детлаф,1982). Создание фундаментальных уравнений "онтогенетического движения" составляет цель теоретической эмбриологии.

В экологии сообществ объект - популяция организмов. Изменения складываются из процессов рождения и гибели особей. Пространство состояний - набор всевозможных векторов (n1 ,n2 ,...,nw), где ni - численность популяции вида i, входящей в сообщество.

Набор ограничен доступными организмам ресурсами среды. Параметризация изменений в сообществе может основываться на измерении количеств ассимилированных сообществом субстратно-энергетических ресурсов, порождая метаболическое время экосистемы (Левич,1989). Популяционное время в экологии можно измерять и количеством сменившихся поколений (Абакумов, 1969). Закон обобщенного движения конкретного сообщества в пространстве его состояний как функция метаболического времени задается так называемой формулой видовой структуры (Левич, 1980).

Нужна конструкция времени

Цель любой динамической теории состоит в создании L-компонента, т.е. закона обобщенного движения. Эта цель недостижима без корректной разработки O,C,S,T и I компонентов. Наименее отрефлексированы теоретиками-естествоиспытателями C и T компоненты

теорий, создание которых фактически составляет задачу по разработке явной конструкции времени в каждой из исследуемых предметных областей. Свойства мира, диктующие необходимость T компонента теории, состоит в том, что часы, которые мы устанавливаем в системах отсчета, чтобы описать изменение природных объектов, могут быть разными. Но нынешнее теоретическое естествознание пронизано параметризацией изменений с помощью исключительно физических часов (приведенные выше специально подобранные эмбриологический и экологический примеры составляют исключения, а не правило).

L компонент теории - закон движения - есть описание изменений исследуемого объекта с помощью изменений эталонных часов (Шаров, 1989), поэтому от степени адекватности C и T компонентов исследуемым процессам могут зависеть шансы обнаружить и явно выразить закон изменений. Возможно, что трудности получения уравнений движения во многих областях естествознания связаны как раз с несогласованностью физических способов измерения времени с нефизической природой исследуемых закономерностей.

Набросок динамической теории в экологии сообществ.

Подробности построения теории изложены в цикле работ автора (Левич, 1980; 1982). В настоящем разделе на примере экологии сообществ фитопланктона проследим за реализацией предложенных выше методологический установок.

Любые естественные системы иерархичны. Например, элементами уровней биологической иерархии могут служить молекулы, клетки, организмы, популяции, сообщества, ассоциации сообществ, биосфера. В качестве элементарного объекта теории в экологии сообществ предлагается выбрать фрагменты биологической иерархии - сообщества, состоящие из популяций нескольких видов фитопланктона, каждая из которых, в свою очередь, состоит из одноклеточных организмов.

Во всех естественных системах существует генеральный процесс- обязательный феномен замены элементов на каждом из уровней иерархического строения системы. Генеральный процесс идет на всех уровнях и биологической иерархии, не его ли описывал еще Жорж Кювье: "Жизнь представляет более или менее быстрый, более или менее сложный вихрь, направление которого постоянно и который всегда захватывает молекулы, обладающие определенными свойствами; но в него постоянно проникают и из него постоянно выбывают индивидуальные молекулы, так что форма живого тела для него существеннее, чем его вещество. Пока это движение существует, тело в котором оно имеет место, живо, оно живет." (Cuvier, 1817; цит. по В.И. Вернадскому, 1967, с. 65). Изменения, происходящие в сообществе, складываются из процессов деления клеток, их элиминации из сообщества (лизис, выедание, оседание, перенос), интродукции особей в сообщество извне, а также из процессов потребления клетками молекулярных субстратов и энергии из среды.

Пространство состояний системы - всевозможные вектора состояния сообщества n1 ,n2 ,...,nw, где ni - численности каждого из w видов сообщества. Набор состояний ограничен доступными сообществу количествами потребляемых видами субстратно-энергетических ресурсов среды:

 

(1)

 

где Lk - количество ресурса k, имеющееся в среде, и - потребность вида i в ресурсе k.

Конструкция метаболического времени (Левич,1989) предлагает параметризовать изменения естественных систем многокомпонентной величиной, составляющие которой есть количества замененных в генеральном процессе элементов на каждом из уровней иерархического строения системы. Для нашей иерархии эти составляющие есть: количество Δw замененных видов, количества Δni замененных клеток каждой из популяций и количества ΔLk потребленных сообществом ресурсов. "Сопряженность "технологии" измерения времени с такими фундаментальными процессами как рост и деление клетки или обмен веществ указывают на то, что биологические часы - не пристройка к зданию биосистемы, а само здание." (Войтенко, 1985, с. 74). Многокомпонентность метаболического времени системы ставит проблему выбора эталонного уровня и эталонного объекта. Измерения времени иерархической системы с помощью замен элементов наиболее глубоких уровней делает соответствующую временную шкалу наиболее универсальной и наименее дискретной. Однако, набор потребляемых фитопланктоном биогенных веществ молекулярного уровня биологической иерархии достаточно велик и даже предпочтение только лимитирующих деление клеток субстратов сохраняет неоднозначность при выборе фактора для эталонных метаболических часов. Эта кажущаяся чисто технической проблема имеет глубокие теоретические корни. Метаболическое время определено через количество замен элементов. Понятие "количество элементов" строго эксплицируется в теории множеств мощностями (в частности, натуральными числами) для бесструктурных объектов, а любое применение формальных методов для описания естественных систем опирается на структурированные математические объекты. Поэтому корректный подсчет элементов структурированных множеств требует обобщения понятий о количестве. Нужное обобщение для произвольных математических структур дается функторным методом сравнения структур (Шаров, 1977; Левич, 1982) в математической теории категорий. Теория категорий представляет удобный язык для писания естественных систем. Структура (аксиоматика) объектов категории определяет элементарный объект теории. Объекты категории характеризуют состояния системы, морфизмы - допустимые способы изменения состояний. Каждому состоянию системы соответствует его числовой инвариант - мощность образа по функторному представлению структур. Этот инвариант обобщает понятие "количество элементов" на структурированные объекты и, параметризуя эволюцию состояний, играет роль категорного времени систем. Расчеты инвариантов математических структур показывают, что в частных случаях эти инварианты совпадают с Больцмановской формой представления энтропии систем, поэтому функторное сравнение структур приводит к обобщению конструкции энтропии естественных систем, описываемых произвольными математическими структурами. Использования инвариантов математических структур для конструирования T-компонента теории приводит, таким образом, к энтропийной параметризации времени.

Функторное сравнение структур позволяет легко решить и проблему создания L - компонента теории: закон изменения состояний формулируется в виде экстремального принципа, постулирующего эволюцию заданного состояния системы к состоянию с экстремальным значением инварианта, или обобщенной энтропии. Вслед за этим вариационное исчисление позволяет легко использовать принцип для вывода уравнений обобщенного движения. При этом очень важно, что исходные для вариационной задачи функционами (инварианты структур) строго рассчитываются, а не постулируются.

Приложение теоретико-категорной методологии к моделированию альгоценозов приводит к формуле видовой структуры:

 

(2)

 

 

где , а λk - множители Лагранжа, зависящие от лимитирующих рост сообщества ресурсов Lk и однозначно отыскиваемые при решении вариационной задачи с ограничениями в виде неравенств (1).

Таким образом, формула видовой структуры описывает динамику численностей видов в метаболическом времени системы, определяемом k потребленными сообществом количествами лимитирующих ресурсов L. Формула видовой структуры адекватно описывает видовые обилия ценозов, предсказывает действенные методы управления структурой альгоценозов и позволяет исследовать фундаментальные принципы экологии сообществ.

 

Список литературы.

Абакумов В. А. Длина и частота поколений // Труды ВНИРО. 1969. Т. 67. С. 344.

Бауэр Э.С. Теоретическая биология. М.-Л.: изд-во ВИЭМ. 1935. 206 с.

Вернадский В.И. Очерки геохимии // В кн.: Биосфера. М.: Наука. 1967.

Войтенко В.П. Время и часы как проблема теоретической биологии // Вопр. философии. 1985. N.1. С.73.

Детлаф Т.А., Детлаф А.А. Безразмерные критерии как метод количественной характеристики развития животных // Математическая биология развития. М.: Наука. 1982. С.25.

Левич А.П. Структура экологических сообществ. М.: Изд-во МГУ. 1980. 180 с.

Левич А.П. Теория множеств, язык теории категорий и их применение в теоретической биологии. М.: Изд-во МГУ. 1982. 190 с.

Левич А.П. Метаболическое время естественных систем // Системные исследования. Ежегодник. 1988. М.: Наука. 1989а. С. 304.

Шаров А.А. Понятие информации в теории категорий // Семиотика и информатика. Вып. 8. М.: ВИНИТИ. 1977.

Шаров А.А. Анализ типологической концепции времени С.В. Мейена // Рукопись, депонированная в ВИНИТИ. N.7600-В89. М.: ВИНИТИ. 1989. 20 с.

Cuvier G. Le regne animal distribue d'apres son organisation. I., Paris, 1817, р.12.

Poincare H. "La Mesure du Temps". Revue de Metaphysique et de Morale. 1898. t.VI. р.1 (см. кн.: Принцип относительности. М.: Наука.1973. С. 12).